远古时期，黄帝战败群魔，战斗中震裂成两截的宝剑化作两股剑气，进而化为朝云与暮云。彼时，人间一对同名兄弟诞生，却因战乱自幼失散。成年后，朝云成为飞羽军勇士，暮云则成为铜雀军白衣尊者，双方各为其主，互不知情，更在战场上刀兵相见。铜雀军将领淳于越暴虐无道，滥杀无辜，时常侵掠。飞羽军为保境安民，与之常有征战。待朝云逐渐知晓真相后，努力在兄弟亲情的感召下，试图救暮云于危难之中。朝云眼见战争导致民不聊生，痛心疾首，誓要还百姓安居之地。他们在部族少女耶亚希的帮助下，历尽艰险，克服重重困难，找到了象征正义的黄帝剑及精神力量，坚定了心中战胜邪恶、保卫和平的信念。宿命的纠缠终将走向了断。兄弟二人最终展开决战，朝云险胜，轩辕剑气二合为一。此时，朝云感受到了弟弟暮云生前身为轩辕剑所背负的夙愿，毅然决定前往山海界，替其完成未竟之事。最终兄弟同心，联手打败暴虐的淳于越，飞羽铜雀化剑为犁，消弭战火，保一方黎民平安。剑的传说，绵延永恒。