自异世界“祸野”现身的怪物“污秽”，长久以来危害着人世间的安宁。为了对抗这些威胁，一群名为“阴阳师”的人们挺身而出，用智慧与勇气守护着人类。 少年焰魔堂辘轳（花江夏树 配音）曾立志成为史上最强、能祓除所有污秽的阴阳师，却在遭遇惨绝人寰的“雏月之悲剧”后痛失一切，深感灾难不可逆转，遂心灰意冷地放弃了理想，沦为平庸的路人。 某日，来自京都的名门阴阳师少女化野红绪（潘惠美 配音）强势闯入了辘轳的生活，两人在误打误撞之中开始了同居岁月。红绪铲除污秽的坚定决心与惊人实力，渐渐感化了辘轳，让他再度看到希望，重燃心中热血。 与此同时，两人被总会所占卜出正是千百年来所有阴阳师所期盼的“双星之阴阳师”，并被赋予了结为夫妻、生下终结人魔之争的“神子”的命运。在联手与污秽及其他阴阳师的战斗中，他们逐渐成长并加深了彼此的羁绊。然而辘轳也发现，红绪的哥哥石镜悠斗（村濑步 配音）不仅是自己在雏月寮的旧友，更是当年将朋友变为污秽、令自己失去一切的罪魁祸首。 面对能使用禁术“污秽堕落”的强大宿敌，辘轳与红绪逐渐接受了命运，为了保护人类与祓除污秽而战。在经历了一系列激烈的战斗后，他们终于与悠斗展开了最终的决战，以强大的实力与深厚的羁绊，成功击败宿敌，守护了人类的世界。