《十三格格新传》由真实历史改编而成，讲述了清朝末年北洋水师兵败之后，惊惶失措的慈禧太后紧急召十三格格回宫辅佐政务的传奇故事。留洋多年的十三格格学以致用，凭借过人的智慧巧妙周旋于各种旧势力之间，虽几经风险，终得全身而退。 北洋水师大败，慈禧接十三格格回宫辅佐政务。十三格格向慈禧献上铁路图，恭亲王奕欣举荐铁路专家张海生辅佐十三修建样板铁路。修建铁路的过程中，玄亲王带头抗拆，李莲英的三弟也带头私搭乱盖，企图多骗补偿款。十三格格亲临第一线，调查取证，指挥若定，终于将他们制服。慈禧的弟弟、隆裕的父亲桂祥以给百姓钉门牌为理由横征暴敛，导致百姓暴动，十三格格闻知此事毫不姑息，将其依法惩办。在合作的过程中，十三格格与张海生逐渐产生了真挚的感情。 然而，七贝勒因深爱十三格格以致因爱成狂，甚至误了大事，被慈禧贬到东陵看守皇陵。慈禧在十三的劝告下，决定和皇帝一起祭拜东陵，给人以帝后和睦的印象。李莲英的管家却将这个消息卖给了匪徒，匪徒沿路狙击慈禧，幸得七贝勒飞身相救。匪徒最终被剿灭，但七贝勒也在此战中悲壮殒命。 一年后，十三格格挽着张海生，在七贝勒的坟前默默祭拜。历经晚清风云与生死爱恨的洗礼，她以过人的智慧与坚韧，在新旧势力的激烈交锋中迎来了属于自己的新生。