2023年，日本东京。东山总理（仲村亨 饰）在世界环境会议上高调宣布将进一步推进“COMS”计划。随后，官房长官长沼周也（杉本哲太 饰）公开表示，东山总理将以构建“未来的日本”为宏伟目标，打破常规，从各省厅选拔出拔尖的年轻官僚，正式成立“日本未来推进会议”。在这场汇聚精英的盛会中，环境省的天海启示（小栗旬 饰）与经济产业省的常盘纮一（松山研一 饰）双双入选。与此同时，一篇由田所雄介（香川照之 饰）撰写的报道在网络上掀起狂澜，他敲响了“关东沉没”的末日警钟。这篇报道迅速引发部分民众团体的不安与示威抗议，为了平息愈演愈烈的事态，天海主动出面与田所进行交涉。然而，面对天海的质问，田所对其劝告充耳不闻，并抛出了一个令人毛骨悚然的预言：“不久之后，伊豆海域将有一座岛屿沉没。”怀揣着一丝不安与疑虑，天海决定与常盘一同前往相关海域进行潜水勘察。然而，就在深邃的海底，两人竟遭遇了一幕极具冲击性、足以颠覆日本命运的震撼景象……